Az Agrár- és Élelmiszeripari Kutató Központ (SZE-AÉKK) legfőbb célja, hogy a mezőgazdasággal és az élelmiszeriparral (élelmiszertudománnyal) összefüggő kutatási tevékenységeket szervezze.
A Központ részt vesz a releváns K+F+I pályázatok megírásában és végrehajtásában.
A SZE-AÉKK koordinálja az agrár- és élelmiszeripari kutatások és vállalati együttműködések kiszolgálását biztosító laboratóriumok (pl. víz-, talaj-, takarmány- és élelmiszerminták fizikai, kémiai és mikrobiológiai vizsgálata) működését.
A Központ stratégiai célja olyan innovatív kutatóegységek kialakítása, amely a precíziós élelmiszerelőállító termékpályához kötödő gyakorlatorientált oktatási és kutatási feladatok támogatását segítik elő.